新冠病毒突變了!部分檢測試劑盒將失效!

到目前為止,2019新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)基因組被認為比SARS-CoV或MERS-CoV更穩定。一項來自杜克-新加坡國立大學醫學院的最新的研究顯示,SARS-CoV-2已發生一段長度達382個核苷酸的大片段缺失突變(?382),該缺失突變是SARS-CoV-2病毒感染人類后的第一次重大變異事件,也提示檢測該基因片段的新冠試劑盒將失效。研究人員認為該缺失突變會使SARS-CoV-2更適應感染人類宿主,并且該?382變異的病毒已經傳播了至少四周。

先前的研究表明,開放閱讀框架8(ORF8)基因片段是SARS相關冠狀病毒的進化熱點,ORF8區域已被證明在導致2003年”非典“的SARS-CoV的物種間傳播、病毒復制效率以及適應人類宿主等方面發揮了重要作用。

來自的一項最新的研究顯示,研究人員在8名新加坡住院的SARS-CoV-2感染患者中,發現SARS-CoV-2基因組均存在一段長度達382個核苷酸的大片段缺失突變(?382),?382片段幾乎完全覆蓋了SARS-CoV-2的ORF8基因片段及其轉錄表達調節序列(TRS),導致ORF8基因不能表達,?382是SARS-CoV-2病毒進入人類后的第一次重大變異事件。

圖示:SARS-CoV-2存在一段長度達382個核苷酸的缺失突變(?382)

病毒核衣殼內最重要的蛋白之一就是核衣殼蛋白(N,Nucleocapsid Protein),主要負責RNA的復制功能。核衣殼蛋白(N蛋白)常作為新型冠狀病毒診斷檢測工具,是新冠病毒快速診斷試劑核心原料。?382片段缺失會增強下游SARS-CoV-2病毒N蛋白基因的轉錄表達。因此,研究人員推測在該片段的缺失可能會導致SARS-CoV-2更適應人類宿主。進一步研究還發現,?382病毒已經傳播了至少四周。

圖示:?382增強下游N蛋白基因的轉錄表達

最后,鑒于ORF8是SARS相關冠狀病毒的進化熱點,且已被證明在SARS-CoV的物種間傳播、病毒復制效率以及適應人類宿主等方面發揮了重要作用。因此,隨著SARS-CoV-2在人類中的持續傳播,我們很可能會發現更多的病毒變異。而且后續的研究應當注重?382 SARS-CoV-2病毒導致的表型變化以及該基因組標記物在分子流行病學調查研究中的應用。

參考文獻:

Discovery of a 382-nt deletion during the early evolution of SARS-CoV-2

本文來自精準醫學君、醫知圈

弗雷賽斯

-浙江大學碩博創建于2015年

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